Master in Bioinformatica per Genomica computazionale

Il Master ("Laurea Magistrale") in "Bioinformatica per la genomica computazionale " è un'iniziativa congiunta dell'Università di Milano e del Politecnico di Milano e sarà attivato a partire dall'Anno Accademico 2019-2020.

Nel complesso, si propone di formare "scienziati del genoma" , cioè laureati che abbiano una conoscenza adeguata delle basi molecolari dei sistemi biologici; la struttura e la funzione delle molecole biologiche e il loro modo di partecipare ai processi cellulari; le tecnologie e le piattaforme per l'analisi dei genomi; gli strumenti per bioinformatica e analisi genomica; e le metodologie statistiche e computazionali per l'analisi dei dati biomolecolari.

L'ammissione è aperta a tutti gli studenti con una laurea triennale (laurea triennale) sia in biologia o biotecnologie o simili o informatica, ingegneria, matematica o fisica.

Frequentando i corsi insegnati nel corso BCG imparerai a conoscere:

1. L'organizzazione delle informazioni nel genoma e i processi molecolari e cellulari alla base dell'espressione genica e della sua regolazione.
2. I metodi sperimentali utilizzati per studiare i geni e la loro funzione in diverse specie modello, sia procariote che eucariotiche.
3. Le tecnologie impiegate nella moderna ricerca genomica ed epigenomica, come i saggi basati sul sequenziamento di nuova generazione (sequenziamento del genoma e dell'esoma, sequenziamento dell'RNA, ChIP-Seq e così via).
4. Metodi e protocolli di analisi bioinformatica negli studi di genomica funzionale (sequenziamento del genoma e dell'esoma, sequenziamento dell'RNA, ChIP-Seq e così via).
5. Gli approcci algoritmici, matematici e statistici alla base della bioinformatica e degli strumenti di analisi genomica.
6. Tecnologie di database per l'archiviazione e l'organizzazione dei dati.
7. Tecniche di modellazione e analisi impiegate nella biologia dei sistemi per lo studio delle interazioni in sistemi biologici complessi.

Il programma prevede, come tappa fondamentale nella formazione degli studenti, uno stage in laboratori di ricerca presso l'Università di Milano, il Politecnico o in altri istituti di ricerca italiani o stranieri. L'esperienza di ricerca dello stage e dei suoi risultati sarà descritta in una tesi scritta finale, da discutere di fronte a un comitato di tesi.

Missione e obiettivi

Il Corso di Laurea Magistrale congiunto in “Bioinformatica per la Genomica Computazionale” (BCG) del Politecnico di Milano e dell'Università Degli Studi di Milano si propone di fornire ai propri laureati un'adeguata conoscenza delle basi molecolari dei sistemi biologici; la struttura e la funzione delle molecole biologiche e il modo in cui partecipano ai processi cellulari; le tecnologie e le piattaforme per l'analisi dei genomi; gli strumenti per la bioinformatica e l'analisi genomica; e le metodologie statistiche e computazionali per l'analisi dei dati biomolecolari.

Pertanto, il titolo BCG include attività che forniscono una conoscenza approfondita su:

• L'organizzazione delle informazioni nel genoma e i processi molecolari e cellulari alla base dell'espressione genica e della sua regolazione.
• I metodi sperimentali utilizzati per studiare i geni e la loro funzione in diverse specie modello, sia procariote che eucariotiche.
• Le tecnologie impiegate nella moderna ricerca genomica.
• Metodi e protocolli di analisi bioinformatica negli studi di genomica funzionale.
• Approcci algoritmici, matematici e statistici alla base della bioinformatica e degli strumenti di analisi genomica.
• Tecnologie di database per l'archiviazione e l'organizzazione dei dati.
• Tecniche di modellazione e analisi impiegate nella biologia dei sistemi per lo studio delle interazioni in sistemi biologici complessi.

Soggetti

L'Università Degli Studi di Milano offrirà i corsi incentrati sulle tematiche biologiche, mentre il Politecnico di Milano offrirà quelli computazionali.

1 ° anno

1 ° semestre

• Corsi obbligatori: chimica organica; Bioinformatica e biologia computazionale
• Corsi opzionali: genetica, biologia cellulare e molecolare; Biochimica; Programmazione e basi di dati; Statistiche

2 ° semestre

• Corsi obbligatori: genomica e trascrittomica; Programmazione scientifica; Apprendimento automatico; Biostatistica

2 ° anno

1 ° semestre

• Corsi obbligatori: genomica avanzata ed epigenomica; Chimica strutturale; Biologia dei sistemi e analisi della rete
• Corsi elettivi: progetto interdisciplinare; Genomic Big Data Management and Computing

Opportunità di carriera

Il Master BCG si propone di formare “data scientist”, professionisti altamente qualificati in grado di fondere conoscenze approfondite sui fondamenti molecolari delle scienze della vita con la conoscenza aggiornata delle attuali tecniche e tecnologie per la bioinformatica e l'analisi genomica. Particolare enfasi sarà posta sugli aspetti quantitativi e computazionali di quelli successivi, che saranno focalizzati sull'analisi, modellazione e comprensione dei sistemi biologici. L'obiettivo finale è formare in un contesto multidisciplinare professionisti pronti ad affrontare le sfide derivanti dalle moderne scienze biomolecolari nell'era post-genomica, in grado di coniugare e integrare conoscenze su biologia, genetica, informatica, ingegneria dell'informazione e statistiche in diversi campi della ricerca di base o applicata.

I laureati in BCG saranno quindi in grado di:

• Partecipa alla progettazione e all'esecuzione di analisi genomiche su larga scala.
• Identificare ed estrarre il significato biologico dai risultati ottenuti.
• Strumenti e protocolli di progettazione per l'analisi bioinformatica di diversi tipi di dati sperimentali in modo autonomo.
• Gioca un ruolo fondamentale nei gruppi di ricerca incentrati sulla ricerca genomica di base o applicata.
• Coordina e supervisiona progetti e gruppi di ricerca incentrati su bioinformatica e genomica.

Ammissione

Il prerequisito per accedere al corso di laurea magistrale BCG è una laurea ("Laurea Triennale") che fornisca una conoscenza adeguata di (1) genetica, biologia molecolare e biochimica o (2) informatica, ingegneria dell'informazione e matematica. Inoltre è richiesta la conoscenza della lingua inglese, come di seguito specificato. Gli studenti che non hanno ancora conseguito la laurea possono presentare domanda se intendono laurearsi entro il 31 ottobre 2019 (vedi sotto).

Per l'anno accademico 2019-2020, saranno ammessi al programma al massimo 50 studenti , selezionati sulla base delle loro conoscenze di base e di un colloquio personale.

Requisiti per l'ammissione

Requisiti di ammissione per studenti italiani

Gli studenti italiani possono iscriversi al corso di laurea specialistica BCG, purché soddisfino uno dei seguenti due requisiti:

• Hanno completato un corso di laurea triennale (Laurea Triennale) in una delle seguenti classi:
  • Biotecnologia (classe L2)
  • Biologia (classe L13)
  • Scienze agrarie e alimentari (classe L26)
  • Scienze farmacologiche (classe L29)

e durante i loro studi, hanno acquisito almeno 30 CFU in aree biologiche (SSO BIO) con almeno 18 CFU in Genetica (BIO / 18), Biologia Molecolare (BIO / 11) e Biochimica (BIO / 10)

O

• Hanno completato un corso di laurea triennale (Laurea Triennale) in una delle seguenti classi:
  • Ingegneria dell'informazione (classe L8)
  • Informatica (classe L31)
  • Fisica (classe L30)
  • Matematica (classe L35)

e durante i loro studi hanno acquisito almeno 30 CFU nei settori dell'informatica, ingegneria dell'informazione, ingegneria biomedica, matematica e / o statistica (SSD INF / 01, ING-INF / 05, ING-INF / 06, MAT / 01 -09, e / o SECS-S / 01), con almeno 6 CFU in matematica (MAT / 01-09) e almeno 12 CFU in una o più delle seguenti aree: informatica (INF / 01), informazioni ingegneria (ING-INF / 05), ingegneria biomedica (ING-INF / 06), statistica (SECS-S / 01).

Gli stessi criteri sono applicati ai candidati in possesso di titoli di studio stranieri ritenuti idonei dal Consiglio degli Insegnanti, nel quale è possibile identificare chiaramente le discipline e il numero di crediti acquisiti per ciascuna disciplina. Se ciò non è possibile, i documenti che certificano la carriera dei candidati saranno esaminati in dettaglio dal Consiglio degli Insegnanti al fine di valutare se il loro background è conforme ai requisiti precedenti.

Gli studenti universitari possono presentare domanda ma dovranno conseguire la laurea triennale (Laurea Triennale) entro il 31 ottobre 2019.

Requisiti di ammissione per studenti stranieri

• Studenti in possesso di laurea triennale in un'area di quelle descritte al punto precedente (Requisiti per gli studenti italiani), dove sono chiaramente identificabili i corsi seguiti nelle discipline richieste insieme al numero di ore / crediti dei corsi. Qualora ciò non fosse possibile, i documenti attestanti la carriera degli studenti saranno esaminati dal Consiglio dei Docenti al fine di valutare se il loro background è conforme ai requisiti precedenti.

Requisiti linguistici

• Gli studenti devono essere competenti in inglese, con un livello di competenza B2. Gli studenti già immatricolati all'Università degli Studi di Milano, che non sono in possesso di certificato B2 o equivalente, sono invitati a sostenere un test di livello per dimostrare il proprio livello di competenza e fornirne prova durante il colloquio. In casi eccezionali, gli studenti senza un test di livello B2 possono essere accettati a condizione che il loro livello di conoscenza della lingua inglese, valutato durante il colloquio, sia evidentemente buono.
• La conoscenza della lingua italiana non è richiesta per la partecipazione. Tuttavia, come richiesto dalla normativa, gli studenti stranieri dovranno dimostrare di aver acquisito le conoscenze di base della lingua italiana prima della tesi finale.

Selezione e classifica

Gli studenti che soddisfano i prerequisiti di cui sopra saranno ammessi a un colloquio con i membri del Collegio Didattico per la valutazione delle loro conoscenze scientifiche di base.

L'adeguata preparazione personale dei candidati (nei loro argomenti di base), la loro capacità di comunicare in inglese e la loro motivazione sono elementi decisivi per l'ammissione. Il colloquio valuterà le competenze del candidato su argomenti legati al proprio diploma di laurea.

Il comitato valuterà ciascun candidato su una scala di 100 punti:

• Saranno assegnati fino a 50/100 punti per il curriculum del candidato (il tipo di diploma di laurea frequentato, i voti degli esami, gli ulteriori corsi frequentati, i titoli di studio supplementari, ecc.)
• Per il colloquio verranno assegnati fino a 50/100 punti.

Il punteggio minimo richiesto per l'ammissione è 60/100.

Per l'Anno Accademico 2019-2020, i colloqui per studenti italiani e stranieri residenti in Italia si svolgeranno presso il Dipartimento di Bioscienze, Via Celoria 26, il 16 luglio 2019, alle ore 9.30.

I candidati stranieri non residenti in Italia e che abbiano conseguito la laurea triennale all'estero possono optare per un colloquio online. All'inizio del colloquio, gli studenti devono esibire una carta d'identità o un passaporto validi per l'identificazione.

Iscrizione dopo l'ammissione

Una volta pubblicati i risultati, gli studenti che occupano le prime 50 posizioni della graduatoria di merito devono perfezionare l'iscrizione entro il termine fissato nel bando di concorso. Successivamente, qualora oltre la scadenza iniziale i primi 50 posti disponibili non risultassero saturi, sarà possibile immatricolarsi per gli studenti con graduatoria di merito inferiore, purché abbiano conseguito almeno 60/100 nella prova di ammissione. L'immatricolazione dei laureandi sarà convalidata solo se conseguiranno la Laurea Triennale entro il 31 ottobre 2019. Gli studenti di altre Università, al conseguimento della laurea entro il 31 ottobre 2019, dovranno presentare presso la Segreteria Studenti l'attestazione del titolo conseguito.

Soggetti

L'Università Degli Studi di Milano offrirà i corsi incentrati su argomenti biologici, mentre Politecnico di Milano offrirà quelli computazionali.

1° anno

1° semestre

• Corsi obbligatori: Chimica Organica; Bioinformatica e Biologia Computazionale
• Corsi opzionali: Genetica, Biologia Cellulare e Molecolare; Biochimica; Programmazione e Banche Dati; Statistiche

2° semestre

• Corsi obbligatori: Genomica e Trascrittomica; Programmazione scientifica; apprendimento automatico; Biostatistica

2° anno

1° semestre

• Corsi obbligatori: Genomica Avanzata ed Epigenomica; Chimica Strutturale; Biologia dei sistemi e analisi delle reti
• Corsi opzionali: Progetto interdisciplinare; Gestione e calcolo genomico dei big data

Classifiche QS 2023 (giugno 2022)

• 1° in Italia
• 139esimo al mondo

Frequentando i corsi tenuti nel corso di laurea BCG imparerai a conoscere:

1. L'organizzazione dell'informazione nel genoma ei processi molecolari e cellulari alla base dell'espressione genica e della sua regolazione.
2. I metodi sperimentali utilizzati per studiare i geni e la loro funzione in diverse specie modello, sia procariotiche che eucariotiche.
3. Le tecnologie impiegate nella moderna ricerca genomica ed epigenomica, come i saggi basati sul sequenziamento di nuova generazione (sequenziamento del genoma e dell'esoma, sequenziamento dell'RNA, ChIP-Seq e così via).
4. Metodi e protocolli di analisi bioinformatica negli studi di genomica funzionale (sequenziamento del genoma e dell'esoma, sequenziamento dell'RNA, ChIP-Seq e così via).
5. Gli approcci algoritmici, matematici e statistici alla base degli strumenti di bioinformatica e analisi genomica.
6. Tecnologie di database per l'archiviazione e l'organizzazione dei dati.
7. Tecniche di modellazione e analisi impiegate nella biologia dei sistemi per lo studio delle interazioni in sistemi biologici complessi.

Il programma prevede, come tappa fondamentale nella formazione degli studenti, un tirocinio in laboratori di ricerca dell'Università degli Studi di Milano, del Politecnico o di altri istituti di ricerca italiani o stranieri. L'esperienza di ricerca del tirocinio ei suoi risultati saranno descritti in una tesi scritta finale, da discutere davanti a una commissione di tesi.

Il Master BCG mira a formare "data scientist", figure professionali altamente qualificate in grado di unire conoscenze approfondite sui fondamenti molecolari delle scienze della vita con conoscenze aggiornate delle attuali tecniche e tecnologie per la bioinformatica e l'analisi genomica. Particolare enfasi sarà posta sugli aspetti quantitativi e computazionali di quelli successivi, che saranno focalizzati sull'analisi, modellizzazione e comprensione dei sistemi biologici. L'obiettivo finale è formare in un contesto multidisciplinare professionisti pronti ad affrontare le sfide derivanti dalle moderne scienze biomolecolari nell'era post-genomica, e in grado di coniugare e integrare conoscenze di biologia, genetica, informatica, ingegneria dell'informazione e statistiche in diversi campi della ricerca di base o applicata.

I laureati in BCG potranno così:

• Partecipa alla progettazione e all'esecuzione di analisi genomiche su larga scala.
• Identificare ed estrarre il significato biologico dai risultati ottenuti.
• Progettare strumenti e protocolli per l'analisi bioinformatica di diverse tipologie di dati sperimentali in autonomia.
• Svolge un ruolo fondamentale nei gruppi di ricerca incentrati sulla ricerca genomica di base o applicata.
• Coordinare e supervisionare progetti e gruppi di ricerca incentrati su bioinformatica e genomica.